학장을 필두로 교수회와 학사위원회 그리고 인사위원회, 기획위원회, 기타위원회의 감독 아래,
교무부학장, 학생부학장, 연구부학장, 기획부학장, 대외부학장, 학사부학장, 정보화본부장, 국제화본부장
행정실장이 실무를 총괄하며,
각각 이들의 감독아래 교학/서무/시설 행정실, 공학연구원, 기획실, 대외협력실, 교육연구재단, 공학교육혁신센터, 정보화지원실이 운영된다.

학장 겸무 공학전문대학원장을 필두로 부원장, 응용공학과장, 행정실로 운영된다.